Vào ngày 13 tháng 1 năm 2016, Mundell công khai là người đồng tính trên trang web cá nhân của mình; ông được cho là bộ trưởng nội các bảo thủ đồng tính công khai đầu tiên.[3][4] Biệt danh của ông là 'Fluffy'.[5]

Trước đây anh đã kết hôn với Lynda Carmichael nhưng cặp đôi đã ly hôn. Ông có ba người con, một trong số đó, Oliver Mundell, là MSP bảo thủ cho Dumfriesshire đã giành được ghế trong Quốc hội Scotland vào tháng 5 năm 2016.[6]